MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp26

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017401	TA	3	6	758	763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017401	TTA	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017401	AT	3	6	801	806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017401	A	8	8	823	830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017401	A	6	6	2227	2232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017401	A	6	6	2244	2249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017401	TA	3	6	2256	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017401	TTAAA	2	10	2262	2271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017401	TA	3	6	2273	2278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017401	ATA	2	6	2295	2300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017401	TTA	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017401	ATA	2	6	2358	2363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017401	TAAA	2	8	2376	2383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017401	A	7	7	2398	2404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017401	CT	3	6	2421	2426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017401	A	7	7	2463	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017401	TCC	2	6	3805	3810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017401	TAAT	2	8	3833	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017401	TAT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017401	TC	3	6	3871	3876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017401	TAAT	2	8	3899	3906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017401	TAA	2	6	3922	3927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017401	TAAT	2	8	3935	3942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017401	ATA	2	6	3950	3955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017401	AT	3	6	3969	3974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017401	TAA	2	6	3978	3983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017401	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017401	AT	3	6	3999	4004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017401	TATAA	2	10	4007	4016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017401	AT	3	6	4027	4032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017401	ATA	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017401	ATT	2	6	4045	4050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017401	TAAA	2	8	4057	4064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017401	TAC	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017401	TAA	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017401	AT	3	6	6533	6538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017401	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017401	TAA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017401	ATT	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017401	AAATT	2	10	6630	6639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017401	TA	3	6	6648	6653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017401	CAA	2	6	7748	7753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017401	ACTTT	2	10	7755	7764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017401	T	6	6	7762	7767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017401	ATA	2	6	8771	8776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017401	A	7	7	10681	10687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017401	A	7	7	10707	10713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017401	TA	3	6	10722	10727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017401	TA	3	6	10734	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017401	TTG	2	6	10763	10768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017401	AAT	2	6	10778	10783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017401	A	6	6	10821	10826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017401	AAT	2	6	10837	10842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017401	ATTT	2	8	10877	10884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017401	AAAT	2	8	10893	10900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017401	A	8	8	11433	11440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017401	ATA	3	9	11456	11464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017401	T	6	6	11467	11472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017401	AATT	2	8	11501	11508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017401	ATT	2	6	11526	11531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017401	CTT	2	6	11538	11543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017401	TTTA	2	8	11554	11561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017401	T	6	6	11690	11695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017401	ATTT	2	8	11710	11717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017401	T	7	7	11715	11721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017401	A	6	6	11725	11730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017401	TAA	2	6	11731	11736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017401	TAAA	2	8	11740	11747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017401	ATAA	2	8	11764	11771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017401	ATT	2	6	11783	11788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017401	T	6	6	11787	11792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017401	TAA	2	6	11800	11805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017401	CAAT	2	8	11817	11824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017401	ATT	2	6	11856	11861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017401	AAT	2	6	11893	11898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017401	TAA	2	6	11910	11915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017401	AT	3	6	11938	11943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017401	AAATTT	2	12	11959	11970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017401	ATT	2	6	13684	13689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017401	ATT	3	9	13695	13703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017401	A	7	7	13737	13743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017401	TATT	2	8	13766	13773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017401	AGA	2	6	13808	13813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017401	GTTA	2	8	13840	13847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017401	T	6	6	13864	13869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017401	TTA	2	6	16682	16687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017401	TTC	2	6	16768	16773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017401	AT	3	6	16786	16791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017401	GAA	2	6	16793	16798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017401	A	6	6	16803	16808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017401	T	6	6	16812	16817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017401	A	6	6	16823	16828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017401	TTG	2	6	16842	16847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017401	TAA	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017401	ATAA	2	8	16860	16867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017401	AGG	2	6	16870	16875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017401	A	6	6	17547	17552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017401	AAGA	2	8	17583	17590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017401	T	7	7	17605	17611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017401	A	6	6	17619	17624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017401	CTT	2	6	17676	17681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017401	AAG	2	6	17685	17690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017401	TAA	2	6	17712	17717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017401	T	6	6	17807	17812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017401	TAG	2	6	17823	17828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017401	GTT	2	6	17859	17864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017401	A	6	6	17883	17888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017401	T	6	6	17898	17903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017401	T	8	8	17943	17950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017401	CTC	2	6	19331	19336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017401	ATTTT	2	10	19339	19348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017401	TTG	2	6	19374	19379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017401	TAA	3	9	19390	19398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017401	AT	3	6	19400	19405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017401	AAT	3	9	20821	20829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017401	TTATA	2	10	21859	21868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017401	TAAAG	2	10	23185	23194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017401	TAAA	2	8	23195	23202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017401	TGA	2	6	24515	24520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017401	ATTT	2	8	24559	24566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017401	ATTTA	2	10	24571	24580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017401	AAT	2	6	24582	24587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017401	AATGAA	2	12	24591	24602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017401	T	6	6	24664	24669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017401	A	6	6	24740	24745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017401	TAT	2	6	24766	24771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017401	ATTA	2	8	24776	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017401	TAAT	3	12	24787	24798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017401	TAA	2	6	24806	24811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017401	ATATA	2	10	26464	26473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.